Disbiosis o adaptación: ¿Qué tan estable es el microbioma intestinal?

Altern Ther Health Med. 2016 Oct;22(S3):10-12

Propósito del estudio

Explorar la relación de causa y efecto con respecto a los cambios en la microbiota intestinal.

Intervención

​Comentario / revisión de datos, no sistemático.

Resultados principales:

• Los resultados de las pruebas de mapeo de microbiota pueden mostrar el efecto de la alteración de la consistencia y frecuencia de las heces y NO mostrar la causa.
• Una parte de la microbiota normalmente puede ser variable y puede cambiar en la adaptación al medio ambiente, la dieta y / o la patología.
• Es probable que no haya una microbiota ideal.

Resultados adicionales:

• Un núcleo de especies puede ser muy estable en el tiempo.
  • En general, han descubierto que un microbioma central bastante grande (aproximadamente 40 especies de bacterias) permanece estable en un individuo en el transcurso de al menos 1 año (1).
  • De hecho, un estudio histórico publicado en Science con muestras fecales de 37 individuos mostró que la microbiota intestinal "núcleo" de una persona es notablemente estable durante más de 5 años (los autores especulan durante décadas) (2).
  • Los autores también demostraron que las especies centrales que se encuentran en miembros cercanos de la familia son muy similares y que las especies dentro del phylum Bacteroidetes y Actinobacteria son más estables que las de otros phyla (por ejemplo, Firmicutes).
• Según el análisis más completo hasta la fecha, una miríada de una variable impacta la microbiota. Dos de los más impactantes fueron el uso de antibióticos o laxantes o la consistencia de las heces.
  • Uno de los análisis más completos del microbioma central de adultos fue publicado recientemente por Falony et al (3) llamado el Proyecto Flamenco de la Flora intestinal (FGFP).
  • De las 503 variables de metadatos que surgieron, se demostró que 69 factores se correlacionan significativamente con la variación general de la comunidad de microbiomas.
  • De todas las covariables detectadas, el 63% fueron impulsadas por medicamentos (principalmente el uso de antibióticos y laxantes), lo que hace que el uso de cualquier medicamento sea la variable explicativa predefinida más grande probada en este estudio.
  • Sin embargo, al dividir las covariables en categorías más pequeñas, la consistencia de las heces, medida por la Escala de heces de Bristol (BSS), surgió como la covariable de microbioma no redundante superior en los metadatos de FGFP
  • Nota: BSS es el puntaje de heces de Bristol
• ¿Qué significa esto? Bueno, todavía está abierto a interpretación. Considero que esto significa que debemos centrarnos primero en la salud del individuo (y sus intestinos) en lugar de centrarnos en el tratamiento de los resultados de los ensayos de mapeo de microbiota. Nota: esta es la opción reflejada por los principales expertos en el campo (es decir, Rob Knight).
• Más datos respaldan la afirmación de que deberíamos centrarnos en normalizar la consistencia de las heces como una forma de mejorar la microbiota, mejor consistencia = mayor riqueza de especies.
• La conexión entre la consistencia de las heces y la abundancia / diversidad de microbiota se ha analizado más a fondo. Vandeputte et al (4) encontraron que la consistencia de las heces (medida por BSS) estaba fuertemente asociada con la riqueza microbiana fecal. Se demostró que la riqueza de especies disminuye significativamente a medida que disminuye la firmeza de las heces (P = .0007), alcanzando su mínimo en las personas con diarrea.
• Los enterotipos (es decir, su tipo de microbiota) también se correlacionan con la consistencia y regularidad de las heces.
  • El grupo también encontró que los enterotipos se distribuyeron entre las puntuaciones de BSS, el enterotipo Prevotella fue más abundante en heces más sueltas (P = .019), y el enterotipo Ruminococcaceae-Bacteroides dominó completamente las muestras más firmes (P = .019), lo que sugiere que los enterotipos pueden ser un marcador sustituto del tiempo de tránsito intestinal porque el tiempo de tránsito puede seleccionar bacterias con ciertos rasgos.
  • Por ejemplo, los individuos con un tiempo de tránsito corto pueden tener mayores cantidades de especies bacterianas de rápido crecimiento, mientras que aquellos con tiempos de tránsito lentos pueden seleccionar bacterias con mayor adherencia al tejido del huésped.

• El diagrama anterior ayuda a admitir algunas de las siguientes declaraciones. Resumido como: una parte de la microbiota es variable y los cambios en esta microbiota variable pueden servir como adaptaciones al medio ambiente o la patología, sin consecuencias para la microbiota central. 
  • Pueden ocurrir cambios sutiles e importantes en el microbioma comensal variable sin alterar fundamentalmente la estabilidad a largo plazo de las especies centrales (al menos según lo determinado por el análisis de la microbiota fecal).
  • Esto significa que las diferencias en la microbiota fecal (más allá de la enumeración y proporción de especies centrales) pueden reflejar adaptaciones a los cambios ambientales o fisiopatológicos que pueden seguirse de manera significativa en la investigación clínica o en la aplicación clínica.
  • Por último, una porción significativa de la microbiota es transitoria; la mayoría proviene de nuestros alimentos (incluidos los probióticos), agua, aire y medio ambiente. Estos microorganismos rara vez persisten más allá de una o dos semanas, pero pueden ser moduladores importantes tanto del microbioma central como del microbioma variable, e influyen en gran medida en la fisiología del huésped.

¿Existe una microbiota ideal?

• Aquí está la respuesta del autor, en resumen NO porque cambia y se adapta constantemente.
  • Esta es una pregunta muy complicada. Si la pregunta implica un conjunto básico de especies microbianas que es ideal para cualquier sujeto humano que viva en cualquier lugar, entonces la respuesta es "no".
  • Sin embargo, creemos que es probable que haya un microbioma adecuado para cada persona, uno que se adapte adecuadamente a su geografía, genética, dieta y entorno particulares.
  • De hecho, si estamos en lo correcto al entender el microbioma como el último sistema de órganos adaptable, la microbiota dentro del tracto gastrointestinal (y, por lo tanto, en la muestra fecal) debería cambiar con la edad, con los cambios estacionales en la dieta y con el estado de salud
• Y como he afirmado en numerosas ocasiones, no deberíamos buscar replicar las microbiotas de cazadores-recolectores
  • La comparación del microbioma de los sujetos occidentales que consumen dietas monótonas y pobres con el microbioma de los cazadores-recolectores que comen estacionalmente muestra diferencias dramáticas. Aunque algunos describirían la microbiota de estos cazadores-recolectores como ideal, probablemente sería poco sostenida y adecuada para beneficiar al sujeto occidental que lleva una dieta occidental estándar.
• La microbiota intestinal se adapta a varios trastornos gastrointestinales.
  • Como veremos, los cambios generales en la microbiota fecal son indicativos de ciertos trastornos gastrointestinales (en comparación con individuos de control "sanos"). Algunas de estas alteraciones reflejan cambios importantes a nivel de phylum, mientras que otros son cambios sutiles en 1 o 2 especies.
• A saber, la disfunción inmune GI puede conducir a una microbiota GI alterada
  • Una nueva investigación ahora sugiere que en algunos pacientes, el sistema inmunitario puede malinterpretar un microbioma "normal" como "disbiótico" debido a polimorfismos genéticos en una variedad de receptores inmunes encargados de interpretar el entorno microbiano intestinal (5).
  • ciertos organismos comensales pueden desencadenar una respuesta inapropiada cuando el sistema inmunitario del huésped malinterpreta su patrón molecular como "patógeno" (p. ej., inflamación, autoinmunidad, reactividad cruzada).
• Esto puede provocar disbiosis inducida genéticamente.
  • ... puede dar como resultado una regulación inmune disfuncional de los organismos comensales dentro del intestino (p. Ej., Niveles reducidos de inmunoglobulina secretora A para atacar a los patobiontes). Esto reduce la precisión de la vigilancia inmune dentro del tracto gastrointestinal, lo que permite un desequilibrio en los organismos comensales, creando una disbiosis inducida por la genética derivada del huésped (6).

Conclusiones clínicas:

• Las pruebas de mapeo de microbiota, aunque interesantes, no son clínicamente accionables porque dicen más sobre el efecto que la causa. Además, porque los resultados son muy variables.
• No hay una microbiota ideal.
• El enfoque principal debe ser enfocarse en la salud del paciente (es decir, su consistencia de heces, frecuencia y aparentemente su salud / síntomas generales), y no tratar los resultados de un ensayo de microbiota.
• Qué decirles a sus pacientes:
  • Nos centraremos en las pruebas de hallazgos clínicamente accionables, por ejemplo, SIBO y pylori, en lugar de mapear su microbiota, que desafortunadamente no es clínicamente accionable, a pesar de lo que proclaman los gurús de Internet.
  • Una de las acciones más poderosas que podemos tomar para mejorar su microbiota es mejorar la frecuencia y consistencia de sus heces.